Zarząd Główny jest jednym z organów naczelnych władz Stowarzyszenia Księgowych w Polsce. Składa się z jedenastu członków wybranych przez Krajowy Zjazd Delegatów oraz z prezesów zarządów oddziałów okręgowych.
Zarząd Główny wybiera ze swego grona Prezydium Zarządu Głównego składające się z prezesa, dwóch wiceprezesów, sekretarza oraz skarbnika.
Skład Prezydium w kadencji 2019 - 2022:
Jerzy Koniecki – Prezes
dr Teresa Cebrowska – Wiceprezes
dr hab. prof. US Stanisław Hońko – Wiceprezes
Leszek Lewandowicz – Sekretarz
Bożena Wilk – Skarbnik
Członkowie Zarządu Głównego w kadencji 2019 - 2022:
- Grzegorz Bosy – członek
- Agnieszka Gajewska – członek
- Kazimierz Jarosz – członek
- prof. dr hab. Aldona Kamela-Sowińska – członek
- Adam Kęsik – członek
- Anna Socha – członek
- Arkadiusz Szeląg – członek
- Franciszek Wala – członek
- dr Katarzyna Zasiewska – członek
- Małgorzata Sokół-Kreczko – prezes Zarządu O/O w Białymstoku
- Sabina Urbańska – prezes Zarządu O/O w Bielsku-Białej
- dr Grażyna Voss – prezes Zarządu O/O w Bydgoszczy
- Joanna Nowowiejska-Fedecka – prezes Zarządu O/O w Częstochowie
- Zdzisław Gładki – prezes Zarządu O/O w Elblągu
- Dorota Kania – prezes Zarządu O/O w Gdańsku
- Łukasz Drewniak – prezes Zarządu O/O w Gorzowie Wlkp.
- Henryk Herman – prezes Zarządu O/O w Katowicach
- Halina Gąsior-Mikulska – prezes Zarządu O/O w Kielcach
- Danuta Buchowiecka – prezes Zarządu O/O w Koszalinie
- dr Łukasz Górka – prezes Zarządu O/O w Krakowie
- Karina Grobelny – prezes Zarządu O/O w Legnicy
- Stefan Czerwiński – prezes Zarządu O/O w Lublinie
- Alina Gumkowska – prezes Zarządu O/O w Olsztynie
- Sebastian Kuś - prezes Zarządu O/O w Opolu
- prof. dr hab. Wiktor Gabrusewicz – prezes Zarządu O/W w Poznaniu
- Janusz Czerwieniec – prezes Zarządu O/O w Radomiu
- Krzysztof Cieśla – prezes Zarządu O/P w Rzeszowie
- Teresa Kamińska – prezes Zarządu O/O w Suwałkach
- Jerzy Czechowicz – prezes Zarządu O/O w Toruniu
- Krystyna Urbaniak – prezes Zarządu O/O we Włocławku
- prof. dr hab. Zbigniew Luty – prezes Zarządu O/D we Wrocławiu
- Bolesław Tatarzycki – prezes Zarządu O/O w Zielonej Górze
Do zadań Zarządu Głównego należy:
- wykonywanie uchwał Krajowego Zjazdu Delegatów, podejmowanie uchwał programowych i określanie zadań Stowarzyszenia pomiędzy Zjazdami,
- kierowanie działalnością Stowarzyszenia zgodnie ze statutem oraz uchwałami Krajowego Zjazdu Delegatów,
- zwoływanie zwyczajnego i nadzwyczajnego Krajowego Zjazdu Delegatów, proponowanie porządku i regulaminu obrad oraz przedstawianie mu zgłoszonych i własnych wniosków, w tym także wniosków o nadanie członkostwa honorowego,
- nadawanie odznak honorowych Stowarzyszenia,
- podejmowanie uchwał o utworzeniu, zakresie terenowym działania i siedzibie oraz likwidacji oddziałów okręgowych,
- rozpatrywanie odwołań od uchwał zarządów oddziałów okręgowych,
- powoływanie Rady Naukowej oraz uchwalanie regulaminu jej działania,
- powoływanie stałych komisji i rad,
- zawieszanie w czynnościach zarządów oddziałów okręgowych lub ich członków - w razie ich działania - niezgodnego z prawem lub statutem do czasu wydania przez właściwy sąd koleżeński orzeczenia w sprawie będącej przyczyną zawieszenia,
- tworzenie i likwidacja jednostek organizacyjnych Zarządu Głównego,
- ustalanie podziału składki członkowskiej oraz uchwalanie rocznych planów finansowych Stowarzyszenia,
- podejmowanie decyzji w sprawach majątkowych określonych w art. 42 statutu,
- zatwierdzanie rocznych sprawozdań finansowych Stowarzyszenia oraz podejmowanie decyzji w sprawach podziału zysku lub pokrycia straty,
- składanie sprawozdań ze swej działalności Krajowemu Zjazdowi Delegatów,
- podejmowanie decyzji w sprawie uczestniczenia Stowarzyszenia w spółkach kapitałowych i fundacjach,
- podejmowanie decyzji w sprawie zakładania i prowadzenia przez Stowarzyszenie szkół zawodowych oraz ich likwidacji.
Zarząd Główny wybiera ze swego grona Prezydium Zarządu Głównego.
Do obowiązków Prezydium Zarządu Głównego należy zapewnienie realizacji zadań wynikających ze statutu, uchwał Krajowego Zjazdu Delegatów oraz uchwał Zarządu Głównego.
Prezydium Zarządu Głównego reprezentuje Stowarzyszenie na zewnątrz i działa w jego imieniu.